Vorrei fare in modo di essere avvertito prima di sovrascrivere un file o di cancellarlo. e' possibile?

Si’, basta settare un alias nel file /etc/profile (se si vuole che la modifica riguardi tutti) oppure in ˜/.bash_profile (solo per il proprio account). In particolare aggiungete queste righe:

alias cp=”cp -i”
alias mv=”mv -i”
alias rm=”rm -i”