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Talvolta, soprattutto nel caso dei neofiti, si assiste ad un po’ di confusione tra questi due acronimi e si ritiene erroneamente che la J2EE (Java 2 Enterprise Edition) rappresenti un rimpiazzo della J2SE (Java 2 Standard Edition). In realtà la J2SE costituisce proprio l’ossatura su cui si basa l’architettura J2EE. Quest’ultima (come visto alla domanda 51) è organizzata logicamente secondo una struttura composta da diversi strati (layers), ognuno dei quali è costituito da opportuni componenti. La J2SE, in sostanza, può essere considerata come la base della piramide per ciascun componente J2EE.